Die Auflagen der Regierung, um Religionsgemeinschaften in Nicaragua rechtlich anzuerkennen, ähneln den Auflagen für andere Nichtregierungsorganisationen. Eine Gruppe muss sich um den Rechtsstatus einer personería jurídica (Rechtspersönlichkeit) bewerben, welche die Nationalversammlung genehmigen muss. Wenn diese genehmigt ist, muss die Gruppe sich beim Regierungsministerium als eine Vereinigung oder Stiftung eintragen lassen.
Die Kirche bewarb sich erfolgreich um Anerkennung als eine Religionsgemeinschaft. Per Dekret Nr. 4734 des Präsidenten der Republik Nicaragua, das im offiziellen Tagebuch vom 7. September 2006 veröffentlicht wurde, ist die Scientology Kirche von Nicaragua als eine religiöse Vereinigung eingetragen worden.
„Der Präsident der Republik Nicaragua und die Nationalversammlung der Republik Nicaragua verfügen Folgendes: Sie gewähren der Vereinigung der Scientology Kirche von Nicaragua Rechtsfähigkeit, einer gemeinnützigen Organisation mit nicht endlichem Bestand und Sitz in der Stadt Managua, Region Managua.“