Es gibt ungefähr 30 religiöse Organisationen, die bei der Sektion für religiöse Angelegenheiten des Innenministeriums von Taiwan eingetragen sind. Religiöse Organisationen können sich bei den zentralen Behörden durch ihre inselweiten Vereinigungen eintragen lassen. Dies kann entweder gemäß dem Gesetz für Tempel-Management, dem Gesetz für zivilgesellschaftliche Organisationen oder gemäß dem Kapitel des Zivilgesetzbuchs geschehen, welches Stiftungen und Vereinigungen behandelt. Am 14. März 2003 fügte das Innenministerium Taiwans die Scientology Kirche seiner Liste von offiziell anerkannten Religionsgemeinschaften hinzu.
„Sobald die Religion des Antragstellers als eine neue Religion betrachtet wird, müssen beim Ministerium Informationen über ihre religiösen Lehren, Zielsetzungen, religiösen Schriften, Rituale, den Aufbau ihrer Religionsgemeinschaft usw. zur Bezugnahme eingereicht werden. Daher wurde es genehmigt, den Status Ihrer Organisation aufzuwerten. Sie wird jetzt als eine nationale religiöse Körperschaft anerkannt. Dies ist jetzt also eine Tatsache, Ihre Körperschaft ist als eine neue Religion anerkannt.“
