In Kroatien definiert das Gesetz über die Rechtslage von Religionsgemeinschaften aus dem Jahr 2002 die Rechtslage von Religionsgemeinschaften und behandelt Regierungsförderung, Steuervorteile und Religionsunterricht an Schulen. Die Eintragung religiöser Gruppen ist nicht obligatorisch. Allerdings erhalten eingetragene Gruppen den Status einer „juristischen Person“ und genießen Steuervorteile und andere Vorzüge.
Die Scientology Kirche Kroatien wurde am 22. Dezember 2003 offiziell als eine religiöse Organisation im Register der Religionsgemeinschaften der Republik Kroatien eingetragen. Das Justizministerium hat nicht nur die Scientology Kirche von Kroatien anerkannt, sondern auch die Religion Scientology, sodass in der Zukunft weitere religiöse Organisationen der Scientology eingetragen werden können.
„Genehmigung, die SCIENTOLOGY KIRCHE IN KROATIEN … im Verzeichnis der Religionsgemeinschaften in der Republik Kroatien einzutragen.“
